L’articolo 38 dell’Atto di Mediazione del 19 febbraio 1803 non menziona la Cancelleria bensì il cancelliere e il segretario di Stato. Lo stesso anno la Dieta federale stabilisce che, nella misura del possibile, essi devono essere di diversa provenienza e differente confessione (protestante o cattolico). Il Cantone direttore competente versa i loro salari e fornisce le loro abitazioni. Siccome a ogni fine d’anno cambia il Cantone direttore della Dieta federale, a ogni fine d’anno la Cancelleria federale si trasferisce nel nuovo Cantone direttore con l’insieme del materiale e degli atti. Si tratta spesso di un’impresa faticosa a causa dei trasporti di allora, in particolare in caso di cattivo tempo.

5 luglio: l’allora segretario generale del Direttorio della Repubblica elvetica, Jean Marc Samuel Isaac Mousson, è eletto a Friburgo primo cancelliere della Confederazione. La Cancelleria è la sola istituzione permanente che dia una certa impressione di continuità e stabilità. Il cancelliere ha una grande influenza sul Landamano che gli è superiore ma cambia ogni anno.