A la fin des années 90, différents événements avaient mis en évidence la nécessité de détecter à temps les menaces potentielles qui pèsent sur la Suisse. De plus, diverses interventions parlementaires exigeaient la création d'un organe de direction du renseignement.

En édictant, le 3 novembre 1999, les "Directives sur l'organisation de la conduite de la politique de sécurité", le Conseil fédéral a inauguré une première phase du développement des nouveaux instruments de conduite de la politique de sécurité.

La Délégation pour la sécurité est une délégation du Conseil fédéral dont le but est de renforcer la capacité du collège gouvernemental de conduire la politique de sécurité. Elle prépare les délibérations et les décisions du Conseil fédéral relatives aux questions de politique de sécurité en temps opportun. Elle est composée des chefs du DFAE, du DFJP et du DDPS. La présidence change en principe chaque année.

L'Organe de direction pour la sécurité est un organe d'état-major de la Délégation du Conseil fédéral pour la sécurité, subordonné à celle-ci et chargé de tâches préparatoires. Il suit en permanence la situation et ses évolutions possibles dans tous les domaines relevant de la sécurité, en Suisse et à l'étranger, sur la base d'informations et d'analyses fournies par les divers départements et par le Bureau d'appréciation de la situation et de détection précoce. En outre, il élabore des scénarios, des stratégies et des options à l'intention de la Délégation pour la sécurité et il tient la liste des besoins permanents du Conseil fédéral en matière de renseignements.

Le Coordonnateur du renseignement est membre de l'Organe de direction pour la sécurité et dirige le Bureau d'appréciation de la situation et de détection précoce. Il gère également le secrétariat de l'Organe de direction et de la Délégation du Conseil fédéral pour la sécurité et apporte son soutien à la présidence de l'Organe de direction dans la préparation des séances. Le Coordonnateur informe les fournisseurs de renseignements de la Confédération des priorités politiques et des besoins du Conseil fédéral.

Lorsqu'il a édicté les directives, le Conseil fédéral a également donné mandat à l'Organe de direction pour la sécurité de lui présenter, dans les 18 mois suivant son institution, un rapport sur les premières expériences réalisées avec les nouvelles structures et de lui soumettre des propositions d'amélioration de celles-ci. En raison des événements du 11 septembre 2001, la Délégation pour la sécurité a différé la présentation du rapport, principalement afin de pouvoir intégrer dans ce document les expériences faites dans une telle situation de crise.

Pour l'essentiel, le Conseil fédéral parvient aux conclusions suivantes: