La Sezione Affari del Consiglio federale organizza la procedura di corapporto, elabora gli ordini del giorno e prepara le sedute del Collegio governativo. All'attenzione dei membri del Consiglio federale e dei loro stati maggiori riassume i corapporti e i pareri inoltrati dai dipartimenti e dalla Cancelleria federale, i cosiddetti elenchi delle divergenze.

Dopo la seduta del Consiglio federale la Sezione Affari del Consiglio federale provvede a redigere e distribuire le decisioni. Custodisce gli incarti fino alla loro archiviazione. Le direttive per gli affari del Consiglio federale disciplinano l'intera procedura.